O órgão coordena o Posto de Saúde da cidade e, através dele, atende os usuários do Sistema Único de Saúde (SUS) nas especialidades de clínica geral, pediatria, ginecologia, obstetrícia e odontologia.

Também oferece serviços de fisioterapia, nutrição, psiquiatria e encaminhamento para clínicas especializadas.

Planeja e executa programas de vacinação para crianças, gestantes e idosos. Distribui medicação básica e encaminhamento para medicamentos especiais.

Promove transporte de doentes para outras cidades. Realiza ações e eventos visando a prevenção.

Farmácia: Fornece medicamentos sem custos para pessoas carentes e para pessoas cadastradas em algum grupo, como hipertensos e diabéticos.

São João Do Manhuaçú conta com cinco postos de saúde disponíveis para atendimento gratuito, sendo;

• 3 dentro da cidade, 2 no centro e 1 no bairro Monte Sinai;
• 1 em Pontões e;
• 1 em São Sebastião Da Vista Alegre